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您可以使用頂層網站及子網站，將網站內容分割成可以個別管理的網站。頂層網站可以有多重子網站，子網站本身又可以有多重子網站，層次可以向下依使用所需無限延伸。這整個頂層網站以及它所有子網站的機構稱為網站集合。
此階層能讓使用者擁有整個小組的工作網站及其他專案的個別工作網站或共用網站。頂層網站及子網站在網站的功能和設定上，可以有不同的控制層次。
在 Windows SharePoint Services 中，有兩中層級的系統管理員：網站集合管理員及系統管理員網站群組成員的使用者。網站集合管理員具有完整的權限可到網站集合中的所有網站。(若需有關網站集合管理員的相關資訊，請參閱修改使用者帳號資訊。) 頂層網站的「系統管理員」網站群組成員可以控制頂層網站及其下任何子網站 (繼承頂層網站的權限) 的功能和設定。(指派使用者到網站群組的相關資訊，請參閱指定使用者到其他網站群組。) 例如，網站集合管理員及頂層網站系統管理員網站群組成員可以執行以下作業：
但是，當子網站使用唯一權限，則較頂層網站的管理員網站群組成員將無法執行上述的操作。相對的，網站集合管理員去一直可以在所有子網站中執行這些操作，而不受到子網站是否有特定權限的限制。
子網站之系統管理員網站群組的成員，則可以控制子網站及其下任何繼承權限之子網站的功能和設定。例如，子網站的系統管理員可以進行下列操作：